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聚焦重要数据价值丨DolphinDB降采样算法介绍

1. 绪论在真实的业务场景中,时间序列数据具有以下特点:采集频率(秒级甚至毫秒级)高,导致数据量非常庞大。数据价值密度低。对数据进行合理的降采样不仅极大地可以降低系统压力、节约存储成本,同时也可以帮助用户聚焦重要信息,提升数据价值。本教程将以要点感知算法为例介绍如何在 DolphinDB 自定义并应

本文目录

    1. 绪论

    在真实的业务场景中,时间序列数据具有以下特点:

    • 采集频率(秒级甚至毫秒级)高,导致数据量非常庞大。
    • 数据价值密度低。

    对数据进行合理的降采样不仅极大地可以降低系统压力、节约存储成本,同时也可以帮助用户聚焦重要信息,提升数据价值。本教程将以要点感知算法为例介绍如何在 DolphinDB 自定义并应用算法降采样数据。

    1.1 行业背景

    在物联网用户场景里,普遍存在这样一种需求:查询某个采集点全年(或一季度、一个月)的数据,并进行展示分析。而在展示时,若呈现所有数据,会引发性能问题,特别是实时展示时。况且,这其实并非必要,因为仅展示大概趋势就足以满足决策要求,过多数据点反而可能干扰决策。就拿折线图来说,在可视化场景中,随着x轴数据不断增多,y轴对应的数据量也会增加,体现在图上的折线就会愈发复杂。当数据量达到一定程度,就很难再从图中找到具体某一个点所代表的真实值,数据变得十分拥挤。下图展示了1个包含1万个数据点的折线图:

    为了能够看到图形的整体,我们就要隐藏一些点,仅展示那些能够代表其他的点,或者是创建能够代表这些点的新数据点,这就是降采样算法解决的问题。

    1.2 业务挑战

    总体而言,在上述物联网时序数据应用场景中,首先需要将数据存下来,再将一定时间跨度的数据进行可视化展示,或者是流计算实时推送数据进行展示,而不对数据进行降采样,会存在以下几个问题:

    • 存储成本:高采集频率、多采集点数据的存储成本极高
    • 数据展示:展示原始数据遭遇性能瓶颈,且大量噪声数据影响局部趋势
    • 数据价值:数据价值不与存储、展示成本成正比

    2. 降采样算法概述

    DolphinDB已内置实现了最大值、最小值、平均值等简单的降采样算法,用户可直接调用相应函数来计算。这些降采样算法都是用一个值来表示多条数据,这样做的好处是计算简单、速度快,但缺点是信息损失较大。除了这些,还有很多学者提出了大量更为复杂、高级的降采样算法,适用于不同的场景。DolphinDB的语言具备强大的编程能力,能支持用户自定义实现复杂的降采样算法。接下来,本文将以PIP算法为例,为大家介绍其算法原理、DolphinDB脚本实现,还会给出案例脚本,用户可在自己的DolphinDB server上直接运行该脚本。

    3. PIP 算法

    3.1 PIP 介绍

    PIP(Perceptually Important Points)算法又叫要点感知算法,是一种时间序列聚合算法,其思路是:对于一个长度为 n 的时间序列数据,迭代地依据最大距离原则采样出 k 个数据点, k 是人为设置的降采样数据点数(k <= n)。PIP 算法的具体步骤如下(论文参考:https://sci-hub.se/10.1109/iscmi.2017.8279589)

    • 第一步:采样出时间序列的第 1 个和最后 1 个样本放入降采样数据点集
    • 第二步:计算剩余未采样样本点到其邻接的 2 个要点构成的直线的距离
    • 第三步:采样出距离最大的样本点放入降采样数据点集
    • 第四步:重复第二步和第三步直到采样要点数达到 k 个

    可以通过下面的演示图片,更直观的感受 PIP 算法的计算过程:

    其中,上述点到直线的距离计算常用的是垂直距离(Vertical Distance),本文中的脚本实现也将采用该距离计算公式。对于点(x3,y3)到另外两点(x1,y1)、(x2,y2)所构成直线的距离的计算公式为

    即为下图中蓝色虚线所示的距离:

    3.2 脚本实现

    DolphinDB 支持用户通过 defg 声明编写脚本实现自定义聚合函数,并且rolling等滑动窗口函数支持调用用户自定义的聚合函数进行滑动计算,因此 DolphinDB 天然支持用户自定义降采样算法进行滑动计算,以下代码为 PIP 算法的脚本实现:

    defg PIP(X, Y){
    data = table(X as x, Y as y)
    rowTab = select x, y, rowNo(x) as rowNo from data
    n = size(X)
    // k为每次滑动降采样的数据量,取值范围为 3~n(n 为滑动窗口大小)
    k = 5
    samples = 2
    result = string(X[0])+"_"+string(Y[0])
    indexList = [0,n-1]
    do{
    distanceVec = [0.0]
    for (i in 0..(size(indexList)-2)){
    start, end = indexList[i], indexList[i+1]
    x1, y1 = X[start], Y[start]
    x2, y2 = X[end], Y[end]
    a = (y1-y2)/(x1-x2)
    b = y1-a*x1
    distanceVec=join(distanceVec, abs(Y[(start+1): end] - (X[(start+1): end]*a + b)))
    distanceVec.append!(0)
    }
    distanceMax = distanceVec.max()
    tmp = table(rowTab, distanceVec as distance)
    nextPoint = select x, y, rowNo from tmp where distance = distanceMax
    result += ","+string(nextPoint.x[0])+"_"+string(nextPoint.y[0])
    indexList = indexList.append!(nextPoint.rowNo[0]).sort()
    samples = samples+1
    }while(samples < k)
    result += ","+string(X.last())+"_"+string(Y.last())
    return result
    }

    3.3 算法性能

    PIP 算法的时间复杂度是 O(n2),得益于 DolphinDB 内置的向量化编程,我们可以将算法的时间复杂度降低为 O(n) ,极大地提升了算法的计算性能,在单机社区版的 DolphinDB 上将 1 千万条的时间序列数据降采样至 4 万条数据只需 1.4s,并且还可以通过多线程的方式进一步提升性能。

    4. 案例演示

    4.1 案例脚本

    本案例将以 1000 万条的正弦波动数据为例,使用 PIP 算法进行降维并展示降维前后的可视化对比,用户可以在自己的 DolphinDB 环境上运行该案例的完整代码。

    • 清理环境
    login('admin', '123456')
    undef(all)
    clearAllCache()
    • 自定义 PIP 算法函数及解析函数
    // PIP 算法聚合函数
    defg PIP(X, Y){
    data = table(X as x, Y as y)
    rowTab = select x, y, rowNo(x) as rowNo from data
    n = size(X)
    // k 为每次滑动降采样的数据量,取值范围为 3~n(n 为滑动窗口大小)
    k = 5
    samples = 2
    result = string(X[0])+"_"+string(Y[0])
    indexList = [0,n-1]
    do{
    distanceVec = [0.0]
    for (i in 0..(size(indexList)-2)){
    start, end = indexList[i], indexList[i+1]
    x1, y1 = X[start], Y[start]
    x2, y2 = X[end], Y[end]
    a = (y1-y2)/(x1-x2)
    b = y1-a*x1
    distanceVec=join(distanceVec, abs(Y[(start+1): end] - (X[(start+1): end]*a + b)))
    distanceVec.append!(0)
    }
    distanceMax = distanceVec.max()
    tmp = table(rowTab, distanceVec as distance)
    nextPoint = select x, y, rowNo from tmp where distance = distanceMax
    result += ","+string(nextPoint.x[0])+"_"+string(nextPoint.y[0])
    indexList = indexList.append!(nextPoint.rowNo[0]).sort()
    samples = samples+1
    }while(samples < k)
    result += ","+string(X.last())+"_"+string(Y.last())
    return result
    }

    // 降采样结果解析函数
    def strToTable(result){
    samplesPIP = keyedTable(`x`y, 1:0, `x`y, `DOUBLE`DOUBLE)
    for (res in result){
    windows = res.split(',')
    for (window in windows){
    row = window.split('_')
    samplesPIP.append!(table([double(row[0])] as x, [double(row[1])] as y))
    }
    }
    return samplesPIP.sortBy!(`x, 1)
    }
    • 模拟数据
    // 模拟 1 千万条正弦数据,大小为 153 MB
    X = (double(0..9999999)*pi/1000)
    Y = sin(X)
    • 结合rolling函数进行滑动计算
    // 调用 rolling 函数进行滑动窗口计算,每 1000 个点滑动 1 次,降采样到 10 个点
    timer{pipResult = rolling(PIP, [X, Y], 1000, 999)}

    // 解析降采样结果输出一张表
    samplesPIP = strToTable(pipResult)

    4.2 结果展示

    DolphinDB 内置了画图函数 plot,用户可以在库内直接调用对数据进行可视化展示,接下来将调用 plot 函数可视化对比降采样前后数据。

    • 原始数据折线图:
    plot(Y[0:10000], X[0:10000])

    • 降采样数据折线图:
    plot(samplesPIP.y[0:100], samplesPIP.x[0:100])

    可见,PIP 降采样算法可以完全保留数据的趋势信息。但在实际业务场景中,需结合实际业务场景合理设置滑动窗口大小及降采样点数。

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